Redest du von der iTunes-Synchronisation oder von der Synchronisation über iCloud?
Beides kannst du abstellen bzw. so abändern, dass nichts synchronisiert wird.

Wenn du den iPod deines Sohnes an iTunes anschließt, kannst du genau festlegen, was synchronisiert werden soll und was nicht. So hast du das auch bei deinem iPad und bei deinem iPod eingerichtet.
Die Synchronisation über iCloud ist standardmäßig zum Teil aktiviert - du kannst aber genau anpassen, was und was nicht synchronisiert werden soll. Die entsprechenden Optionen kannst du auf dem iPod deines Sohnes unter Einstellungen -> iCloud anpassen.

Alles das, was @ AppleFan123 geschrieben hat, stimmt so und man kann es so machen.
Trotzdem würde ich Dir zu einem eigenen Account von Deinem Sohn raten.
Der muss dann "mit eigenem Geld" aufgeladen werden. Es könnte eine kleine Erziehungsmassnahme sein....
Desweiteren....wenn er in der Folge noch ein eigenes iPhone etc. bekommt, dann macht ein eigener Account auf jeden Fall Sinn. Wenn man dann erst einen Account für ihn einrichtet, wird es kompliziert, weil man ein Device auch nur mit einem Account synchronisieren kann....

@hubremen. Danke für die Ergänzungen und die wichtige Info.

Eine Apple ID bietet außerdem noch den Vorteil, dass getrennte Adressen für FaceTime/iMessage/GameCenter etc. vorhanden sind.
Über die Familienfreigabe könntest du aber dennoch beide Konten zusammen verbinden und somit von deinen bisher getätigten Käufen in doppelter Hinsicht profitieren, da du deine Käufe auch auf den iPod deines Sohnes laden kannst.

Guter Hinweis.....;-)